Gilles de Margerie a travaillé près de dix ans dans le secteur public. Tout d'abord à l'Inspection générale des finances puis au sein des cabinets de Roger Fauroux, ministre de l'Industrie et de l'Aménagement du territoire, et de Michel Rocard, Premier ministre. En 2000, il fonde En temps réel, un laboratoire d'idées associant universitaires, élus et représentants de la société civile, dont l'objet est d'appréhender les nouvelles régulations, les mutations de la société et les exigences de la mondialisation. En 2011, il crée la Fondation pour les sciences sociales qui soutient et contribue à diffuser des travaux de recherche dans tous les domaines des sciences sociales.

Pour Gilles de Margerie, "France Stratégie continuera à mettre dans le débat public des analyses sur les grandes évolutions économiques et sociales à moyen et long terme de notre pays dans son environnement européen et international. Elle renforcera ses capacités d'évaluation des politiques publiques et d'organisation de débats et de concertations".